Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms