Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem2Q6NVD0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem2Q6NVD0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms