Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SphkapQ6NSW3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms