Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc66Q6NS45 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc66Q6NS45 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms