Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh1Q6IUP1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh1Q6IUP1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms