Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms