Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms