Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt39Q6IFX4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms