Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Krt40Q6IFX3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Krt40Q6IFX3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt40Q6IFX3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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