Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arhgap20Q6IFT4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap20Q6IFT4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms