Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw2Q6I6G8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms