Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg9bQ6EBV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms