Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pram1Q6BCL1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pram1Q6BCL1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms