Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp7Q6A4J8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp7Q6A4J8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms