Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd6Q69ZL1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd6Q69ZL1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms