Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ric1Q69ZJ7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ric1Q69ZJ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms