Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msl2Q69ZF8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msl2Q69ZF8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms