Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn4Q69Z26 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms