Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3ipQ68EF0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3ipQ68EF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms