Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef39Q66JY6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms