Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms