Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf1Q64213 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms