Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim24Q64127 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms