Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfe3Q64092 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfe3Q64092 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms