Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms