Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga3Q62470 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms