Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcncQ62447 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms