Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hoxa13Q62424 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hoxa13Q62424 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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