Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtmQ62388 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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