Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Six3Q62233 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Six3Q62233 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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