Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema5aQ62217 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema5aQ62217 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms