Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms