Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssr4Q62186 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssr4Q62186 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms