Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms