Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phox2aQ62066 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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