Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga7Q61738 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga7Q61738 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms