Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms