Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms