Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod1Q60867 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms