Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms