Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms