Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgaeQ60677 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms