Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr1h2Q60644 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms