Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2f1Q60632 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms