Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CttnQ60598 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms