Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gprasp1Q5U4C1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gprasp1Q5U4C1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms