Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms