Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms