Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms