Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms